Fluidigm推出單細胞TCR測序產品[新品推薦]

【字體: 時間:2016年06月13日 來源:生物通

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  為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1™系統上推出了一個全新的免疫學應用 – Single-Cell TCR Sequencing。這個應用可揭開每個細胞的T細胞受體(TCR)α和β鏈,同時發現相應的基因表達特征,為研究人員拷問T細胞的功能反應提供了一種新方法。

生物通報道 解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而,T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊,以便識別特定的外源蛋白,引發有效的免疫反應。

為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1™系統上推出了一個全新的免疫學應用 – Single-Cell TCR Sequencing。這個應用可揭開每個細胞的T細胞受體(TCR)α和β鏈,同時發現相應的基因表達特征,為研究人員拷問T細胞的功能反應提供了一種新方法。

這種方法是由歐洲分子生物學實驗室(EMBL-EBI)和Sanger研究院的研究人員開發的,不久前發表在《Nature Methods》雜志上。它從單個T細胞的RNA測序數據中重建配對的T細胞受體(TCR)序列,將T細胞的特異性與功能反應相關聯。(延伸閱讀:單細胞測序為研究免疫反應提供新方法

新的方法將C1系統上成熟的單細胞全轉錄組測序流程與一種名為TraCeR的生物信息學工具相結合,從單細胞RNA測序數據中重建T細胞受體的序列。這個工具包括參考文件,可用于人類和小鼠的測序數據。

“幾乎每個T細胞都有不同的序列和抗原特異性。我們相信,單細胞TCR測序及TraCeR為研究人員帶來了一種工具,可探索T細胞受體序列的多樣性,并將抗原特異性與特定功能反應相關聯,”EMBL-EBI的資深科學家Michael Stubbington談道。

單細胞TCR測序是在C1系統上實現的第15種單細胞方法。其他方法包括RNA測序、靶向基因表達、miRNA分析、基因組測序和外顯子組測序、靶向基因測序和表觀遺傳學應用。每個應用的操作方案、文獻數據等可在Script Hub上找到。

“我們開發C1系統,其目標是實現廣泛的單細胞應用,以解決日益復雜的生物學問題。通過與EMBL-EBI和Sanger這樣的頂尖機構合作,單細胞研究界可利用不斷擴展的C1應用來了解那些與健康相關的重要機制,”Fluidigm的高級營銷副總裁Pete Betzelos說?!拔頤瞧詿飧齙ハ赴τ媚芄淮俳悅庖呦喙丶膊〉牧私?,并有助于新型免疫療法的開發?!保ㄉ锿?余亮)

了解Fluidigm的單細胞TCR測序產品及其他產品

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